Des travaux de restauration du chenal central du Haut-Rhône français à l’aval des barrages de Lavours et Champagneux ont été entrepris en 2005-2006 et ont consisté à augmenter les débits réservés. Les effets de cette opération ont été évalués en étudiant en aval des barrages la structure des communautés de macroinvertébrés (insectes en particulier), d’oligochètes (annélides) et de poissons avant (en 2002/2003) et après (en 2008/2009) sa mise en œuvre. Nous reportons ici les résultats obtenus sur les communautés d’oligochètes. Les oligochètes ont été prélevés au niveau des sédiments grossiers superficiels et la structure des communautés a été étudiée en appliquant la méthode des traits fonctionnels. Cette méthode permet d’évaluer simultanément la dynamique des échanges hydrologiques entre les eaux souterraines et les eaux de surface et les effets des polluants présents dans le milieu et apporte ainsi des informations sur l’état de fonctionnement du cours d’eau. La dynamique des échanges hydrologiques verticaux devrait être prise en considération, entre autres car des alternances exfiltrations/infiltrations favorisent l’autoépuration du cours d’eau et des excès d’infiltrations rendent les eaux souterraines vulnérables aux pollutions des eaux de surface. À l’aval des deux barrages, il a été observé post-restauration (par rapport à l’état pré-restauration) une diminution des pourcentages de taxons indicateurs de la présence d’exfiltrations de la nappe et une élévation des pourcentages de taxons moyennement résistants et résistants aux pollutions. Ces résultats peuvent être expliqués par une qualité chimique de l’eau insuffisante et l’activité des barrages favorisant les dynamiques d’infiltration des eaux de surface. Ils montrent que dans le cas des sites étudiés, une augmentation des débits réservés a été insuffisante pour améliorer le fonctionnement du milieu et que cette opération de restauration devrait s’accompagner de mesures diverses visant à améliorer la qualité des eaux de surface et à favoriser les exfiltrations des eaux souterraines.